ООО "Микротех" организовано от ООО "Предприятие "МикроТех". ООО "Предприятие "МикроТех" создано в июне 1991 г. при Казанском государственном техническом университете (Казанском авиационном институте) и занималось разработкой и мелкосерийным производством контрольно-измерительной аппаратуры для Камского автомобильного завода.
В 1996 г. коллектив уже состоял из 10 штатных сотрудников: производственная группа -6 человек; конструкторско-технологическая группа -3 человека; бухгалтер и директор на основе совместительства. Поскольку в КГТУ (КАИ) была развернута подготовка инженеров биомедицинского направления, было принято решение о выпуске изделий стоматологического направления. Первым серийным изделием был наконечник стоматологический турбинный (Казань) НТС-300-05. Наряду с этим интенсивно проводятся опытно конструкторские и технологические работы по новым изделиям.